Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGSM1Q2NKQ1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms