Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYT16Q17RD7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT16Q17RD7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms