Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPP1R3AQ16821 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPP1R3AQ16821 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms