Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CTF1Q16619 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTF1Q16619 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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