Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FXNQ16595 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FXNQ16595 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FXNQ16595 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FXNQ16595 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FXNQ16595 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FXNQ16595 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FXNQ16595 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FXNQ16595 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FXNQ16595 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FXNQ16595 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FXNQ16595 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FXNQ16595 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FXNQ16595 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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