Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAPC1Q16533 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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SNAPC1Q16533 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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SNAPC1Q16533 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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SNAPC1Q16533 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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SNAPC1Q16533 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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