Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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