Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ZFHX3Q15911 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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