Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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