Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SEC23BQ15437 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SEC23BQ15437 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SEC23BQ15437 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SEC23BQ15437 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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SEC23BQ15437 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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