Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms