Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-1Q15270 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-1Q15270 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
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