Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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