Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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