Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN1Q14699 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN1Q14699 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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