Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms