Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE1CQ14123 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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