Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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