Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASGRF1Q13972 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGRF1Q13972 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms