Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF9Q13886 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms