Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTCH1Q13635 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
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