Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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