Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PICALMQ13492 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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