Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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