Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TARBP1Q13395 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TARBP1Q13395 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms