Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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