Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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ITGB3BPQ13352 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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ITGB3BPQ13352 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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ITGB3BPQ13352 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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ITGB3BPQ13352 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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ITGB3BPQ13352 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3BPQ13352 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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ITGB3BPQ13352 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ITGB3BPQ13352 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ITGB3BPQ13352 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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