Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PTPRSQ13332 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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