Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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