Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TRIM32Q13049 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TRIM32Q13049 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TRIM32Q13049 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM32Q13049 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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TRIM32Q13049 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TRIM32Q13049 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TRIM32Q13049 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM32Q13049 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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