Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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CNTN1Q12860 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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CNTN1Q12860 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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CNTN1Q12860 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTN1Q12860 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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