Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIAQ12857 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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