Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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