Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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