Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms