Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FMODQ06828 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FMODQ06828 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FMODQ06828 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FMODQ06828 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms