Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC9Q06265 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms