Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms