Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms