Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms