Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms