Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms