Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms