Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EFNB1P98172 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNB1P98172 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms