Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASIC1P78348 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASIC1P78348 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms