Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms