Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKP1P63208 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms