Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSX2P58304 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSX2P58304 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSX2P58304 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSX2P58304 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSX2P58304 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSX2P58304 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSX2P58304 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSX2P58304 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms