Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBASH3AP57075 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms