Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms